Zavod na županijskom nivou koordinira, dijelom provodi i evaluira nacionalne programe za rano otkrivanje raka dojke (žene u dobi  50-69 g. svake 2 godine pozivamo na mamografiju), debelog crijeva (osobe u dobi 50-74 g. svake 2 godine pozivamo na testiranje stolice na nevidljivu krv).  Kako bi kvalitetno proveli ove programe i pružili svim stanovnicima Istarske županije mogućnost prevencije najčešćih sijela raka, na pozivanju, besplatnom telefonu (informacije o programima, naručivanja, priprema osoba kojima je preporučena kolonoskopija i sl.) i u osobnom kontaktu u Zavodu rade medicinske sestre (iznad standarda HZZO-a). Zavod u cilju promocije programa i podizanja odaziva poduzima i dodatne aktivnosti (slanje ponovnih poziva neodazvanima na mamografiju, promotivne aktivnosti na javnim mjestima, medijski nastupi, predavanja, doedukacije zdravstvenih djelatnika i sl.).