-Zgradu u kojoj je danas smješten Zavod projektirao je arhitekt Lino Moscheni a izgrađena je 1938. godine za potrebe ustanove javnozdravstenog tipa.
-Na prvom je katu radio Antituberkulozni dispanzer dok su se na drugom katu nalazili laboratoriji.
-Godine 1947. osniva se Sanitarno-epidemiološka stanica kao samostalna ustanova.
-Dana 1. srpnja 1952. sanitarno-epidemiološka stanica integrira se s Domom narodnog zdravlja u jednu ustanovu

Osnovan je 1. ožujka 1956. godine, kao centralna zdravstvena ustanova u Istri, s ciljem:
-proučavanja zdravstvene problematike na terenu,
-prikupljanja i analiziranja statističkih podataka iz zdravstvenih ustanova te
-provođenja konkretnih akcija na rješavanju problema na terenu, a u suradnji s ostalim zdravstvenim ustanovama

Pri mikrobiološkom odjelu formira:
- laboratorij za dijagnostiku tuberkuloze (1957.),
- laboratorij za imunofluorescentnu dijagnostiku (1966.),
Odjel za socijalnu medicinu (1958. i 1959.) s:
- referadom za zaštitu žena i trudnica,
- referadom za zaštitu dojenčadi i male djece,
- referadom za školsku medicinu,
- referadom za antituberkuloznu zaštitu,
- referadom za zubarsku zaštitu;
Stanica za fluorografiju (1958.);
Stanica za deratizaciju, dezinfekciju i dezinsekciju (1961.);
Odjel za plan i analizu (1967.)

-Dana 15. srpnja 1960. godine Higijenski zavod postaje Zavod za narodno zdravlje i socijalni rad.
-Dana 28. travnja 1961. godine Zavod dobiva novo ime - Zavod za zaštitu zdravlja Pula, da bi od 1967. godine obavljao funkciju međuopćinskog zdravstvenog centra za čitavo područje Istre

Rješenjem Trgovačkog suda u Rijeci od 1994. godine Zavod mijenja ime u Zavod za javno zdravstvo Istarske županije.
-Od 1 siječnja 1998. godine u sastav Službe za epidemiologiju Zavoda ulaze epidemiološki timovi iz svih istarskih domova zdravlja.
-Istog datuma osniva se Služba za školsku medicinu u koju ulaze timovi školske medicine koji su se opredijelili isključivo za preventivni rad.
-Od 1. travnja 2004. godine Centar za prevenciju i vanbolničko liječenje bolesti ovisnosti postaje sastavni dio Zavoda kao Služba za prevenciju ovisnosti

U planu je skora dogradnja novog dijela zgrade ZJZIŽ. Projektom dogradnje ustanove dosadašnja površina uvećala bi se za oko tisuću četvornih metara[...]

Tijekom veljače 2020. dovršena je dogradnja novog dijela zgrade ZJZIŽ te je ovime zgrada dobila novu vizuru i povećanje korisne površine Ustanove [...]